婴幼儿需要补充益生菌的理由大致分为两个方面：一是改善免疫力，预防多种疾病；二是促进消化，让宝宝健康快乐地长大。
改善免疫力，预防多种疾病
许多宝宝从健康母体刚出生时是清洁的。在出生后的几天后，宝宝的胃肠道中就会定植细菌。随着肠道内、皮肤上正常细菌的寄存，人体的免疫系统就开始启动、发育，直到基本成熟。婴儿的肠胃系统占到了免疫系统的三分之二，所以胃肠道中正常菌群的的建立就显得至关重要。如果菌群建立过迟或不良，就会出现相应的疾病。
益生菌可为宝宝肠道迅速建立和保持正常菌群。益生菌两大家族包括乳杆菌属和双歧杆菌属。其中乳杆菌对婴儿的作用与成人基本相似。而双歧杆菌对婴幼儿有着重要的意义。因为在人乳中发现了双歧因子。母乳中的双歧因子是由含N一己酰葡萄糖糖胺的多糖组成。目前除人乳外没有其它哺乳动物的乳汁能促进双歧杆菌的生长。双歧杆菌包括婴儿双歧杆菌，两歧双歧杆菌，长双歧杆菌和短双歧杆菌，在婴儿大肠中是优势菌。它们是特定的种，与在成人肠道中的双歧杆菌不尽相同。这些菌属于厌氧菌，不需要氧气生活。它们发酵碳水化合物产生醋酸和乳酸，以及少量的甲酸。就如它的名字一样，婴儿双歧杆菌是婴儿身体胃肠道内天然“居住者”。
宝宝肚中常见的益生菌能够抵抗致病菌从宝宝肠道上入侵并定植。因为它们是夺取营养素的强者且紧紧地黏附于肠道壁。当肠道中“居住”足量的婴儿菌时，有害菌就没有地方“定居”。益生菌产生的醋酸和乳酸增加了肠道的酸度，进一步阻止了不良菌的生长。这些友善细菌还有助于氮素的保留，保证宝宝正常的体重。婴儿的双歧杆菌能阻止硝酸盐转化为潜在致癌物亚硝酸盐，当然，它们还能产生重要的B族维生素及抵御病菌的免疫球蛋白A。
研究表明超过20%的婴儿可能会受到过敏性症状的侵袭，多达25％的新生儿和幼儿受到激烈的，过度的绞痛影响。美国每年有超过位小于12月的婴儿在经受腹泻后死亡。最近国内一项调查显示，在未满周岁的婴儿中间，上呼吸道感染的发病率竟高达79%。益生菌通过代谢可产生短链脂肪酸。该脂肪酸为肠道细胞提供能量，用以强化粘液层。这个粘液层是阻挡病原体和过敏原的屏障。益生菌对绞痛研究的结果公布在年1月发行的儿科杂志上，婴儿由于益生菌的影响减少哭泣时间显著，95％的婴儿减少了百分之五十或以上哭泣时间。
促进消化吸收，愉快健康成长
婴儿期是人类生命生长发育的第一高峰期。婴儿的体重平均每月增长0.5Kg以上，身体平均增长25cm，还有脑重达到成人的三分之二。幼儿虽不及婴儿那么迅猛，但也很旺盛。体重每年增加约2Kg，身高每年平均10cm，头围每年以1cm速度增长。
另一方面，婴幼儿的口腔狭小，唾液分泌少，乳牙正处于萌出阶段。胃容量在不断长大的过程中，胃肠道的消化酶的分泌及蠕动能力也很低。
发育迅猛与消化吸收功能的局限形成了很大的反差，而益生菌促进消化吸收的功能可以很好缓和这一矛盾。有效避免了消化功能的紊乱和营养不良。使宝宝健康成长。例如，在中国缺钙问题较突出，这种钙的缺乏关键是吸收功能弱。益生菌给宝宝带来益处的同时它们也可以促进钙的吸收。益生菌产生的酸性物质能增加肠道的酸度，益生菌的运动可以增加肠的蠕动，有利于钙的吸收。益生菌还能分解乳糖和提高蛋白的消化率。Rasic博士发现当体重过轻的婴儿膳食补充婴儿双歧杆菌后，能够增加氮的驻留，进而帮助孩子达到正常体重。双歧杆菌也会产生B族维生素。这些对新生儿来说非常重要。
由于一些很小的疾病，宝宝常常又哭又闹，表现出对打针喝药的排斥，父母感到很头疼。很多益生菌可以加快某些疾病的恢复，甚至一些益生菌可以直接用于治疗如腹泻等类的疾病。当人体生病时，食欲不振，消化吸收功能减弱主要是肠道菌群偏离了正常平衡。同时缺乏运动来强化自己的身体。益生菌在于强化消化功能，提升食欲，使宝宝尽快从疾病的痛苦中恢复，健康快乐的成长。
宝宝服用益生菌的小贴士：
1、服用抗菌素时。抗菌素尤其是广谱抗菌素不能识别有害菌和有益菌，所以把它们全部杀死。过后补点益生菌会对维持肠道菌群的平衡起到很好的作用。
2、食欲不振、消化不良、急慢性腹泻、大便干燥和颜色深及吸收功能不好引起的营养不良时，都可以给宝宝补充益生菌。
3、早产，剖腹产和不是母乳喂养的宝宝不能从妈妈那儿得到足够的益生菌，为了肠道菌群的正常化，应该适量补充益生菌。
4、对于免疫力低下或者需要增强免疫力的特殊时刻（如某种流行疾病期间），能够起到预防作用。
5、带宝宝出行或旅游时带点益生菌类产品，如果宝宝肠胃不舒服，服用后能够有效缓解。