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TUhjnbcbe - 2022/8/1 18:22:00
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实时直播

年4月17日(周五)19:00

医药加平台直播间

《肠道菌群16S测序分析思路-第12节》

01课程简介

人体胃肠道有超过万亿微生物,它们被称为肠道菌群。近年来,越来越多的研究证实肠道菌群与消化、吸收、代谢、免疫等功能相关,肠道菌群紊乱与肿瘤、腹泻、肥胖、心脑血管、神经系统等多种疾病密切相关。

肠道菌群相关研究也是当前医学和生命科学研究的热点之一,几乎各临床子学科均可与肠道菌群建立关联研究。年国自然中,医学科学部立项项目项,生命科学部立项项目项,共计项。医学科学部,批准资助金额共计44.13亿元,生命科学部批准资助金额共计32.71亿元。其中医学科学部和肠道菌群密切相关的学科有中医学、中药学、消化系统、病原微生物与感染、预防医学等。

肠道菌群的研究离不开16srDNA测序,它主要用于对微生物菌落进行种属鉴定。因为16s测序费用便宜,所以很多研究人员把它作为肠道菌群的前期必做的测序分析。

那么16s测序的优点特点有什么?实验过程怎样?16s和宏基因组测序有何区别?16s测序与代谢组怎样关联?16s测序分析报告的结果怎样解读?

项目类型

题目

金额

面上项目

肠道菌群调控IL-6在Treg缺失免疫缺陷病中的作用和机制

60

面上项目

OSAHS肠道菌群紊乱对5-HT神经通路和颏舌肌功能的影响及机制研究

59

面上项目

肠道菌群对妊娠期糖代谢异常小鼠子代胰岛功能影响的机制研究

56

面上项目

基于近端肠道菌群调控HIF2α途径研究袖状胃切除术治疗肥胖的机制

56

面上项目

乳铁蛋白通过调节肠道菌群防治高血压

56

面上项目

基于肠道菌群-肠肺轴胆碱能抗炎通路探讨大*保护脓*症肺损伤作用机制的研究

56

面上项目

护肝方糖浆调控肠道菌群改善产后抑郁的机制研究

56

面上项目

从肠道菌群-胆汁酸代谢轴失调致脑肠互动异常研究IBS-D肝郁脾虚及痛泻要方作用机制

56

面上项目

针刺调控肠道菌群SCFAs促进2型糖尿病大鼠胰岛β细胞增殖的作用机制研究

56

面上项目

肠道菌群通过SCFAs调控巨噬细胞对肺炎克雷伯菌的吞噬的机制研究

55

面上项目

脂肪肝对脓*症诱发系统炎症的影响及基于肠道菌群的机制探索

55

基于以上的问题,我们开设了这节理论与实践的课程,这次课程基于项目申请和文献发表的角度,给大家介绍肠道菌群16S测序分析及与其他组学整合分析思路。

医药加宋伟老师公开课计划表

网课

标题

概述

基于生信工具方法指导项目申请的思路

第01节

转录组高通量数据分析思路

第02节

疾病公共数据库GEO挖掘分析

第03节

非编码RNA生信分析及ceRNA策略思路

第04节

癌症数据库TCGA分析思路

第05节

多组学整合分析思路

第06节

lncRNA测序或芯片高通量数据生信分析思路

第07节

单细胞测序简介及生信分析思路

第08节

中药网络药理学分析思路

第09节

m6A甲基化测序分析思路

第10节

代谢组学简介及生信分析思路

第11节

蛋白组学简介及生信分析思路

第12节

肠道菌群16s测序分析思路

第13节

待定(根据学员的需求及提议)

02讲师简介

主讲人:宋伟

研究成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向:有十多年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

培训经历:在全国上海、北京、广州、沈阳、济南、武汉等城市举办过几十场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《公共数据挖掘分析》、《TCGAGEO数据库挖掘》、《cytoscape网络图构建与美化》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《非编码RNA生信挖掘及ceRNA分析》、《R语言培训》等

03观看方式

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