导读
假体周围关节感染（periprostheticjointinfections,PJIs）是一种非常常见但棘手的肌肉骨骼感染。其中，真菌PJIs约占所有PJIs病例的1%，属于非典型PJIs且难以治疗，治疗失败率超过50%。真菌病原体鉴定的延迟或遗漏被认为是治疗失败的关键因素。在真菌PJIs中，培养的敏感性低至50%，并且与细菌感染鉴定相比，需要更长的时间才能得到阳性结果。同时，目前对培养阴性PJIs的经验性广谱抗生素治疗方法，通常能够覆盖大多数细菌病原体，但不能覆盖真菌病原体，这进一步加剧了真菌PJIs治疗的困难。
因此，对真菌性PJIs进行及时、准确的诊断，有助于临床医生做出更及时、更有针对性的治疗决定。宏基因组测序作为新型微生物检测方法目前已广泛应用于临床病原体的诊断，但是关于其在真菌PJIs中的诊断效能还未被评估。因此，上海交通医院骨科张先龙主任与沈灏主任团队探讨了mNGS在真菌性PJIs诊断及治疗中的应用价值，结果显示mNGS可以提高PJIs中真菌病原体的检出率，帮助医生及时选择合适的靶向抗菌治疗和手术治疗方法，进一步提高真菌性PJIs治疗的成功率。因此，建议在处理疑似真菌病原体引起的PJIs时使用mNGS作为常规检查。
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文献ID
英文题目：Metagenomicsequencinginthemanagementoffungalperiprostheticjointinfection
中文题目：宏基因组测序在假体周围关节真菌感染治疗中的应用
发表期刊：JournalofInfection
见刊时间：年9月IF：5.
发表单位：上海交通医院骨科张先龙主任与沈灏主任团队
材料与方法
本研究纳入了年10月至年10月期间上海交通医院收治的8例患者，入组患者均被诊断为PJIs（根据肌肉骨骼感染学会的标准），同时培养和/或mNGS病原体检测结果确认为真菌性PJIs。具体信息如表1所示，本研究共招募假体失败(7膝1髋)男性6例，女性2例，其中多数伴有糖尿病、类风湿等共病，典型的临床感染症状持续数周或数月。其中4人在住院前接受了最初的抗生素治疗。3例术前、术中病原体诊断为真菌和细菌混合感染，5例为真菌单一感染。每个患者均经过9个月的随访，所有感染均得到治愈或控制，症状消失，血清学异常消失。根据与培养结果比对及治疗效果随访跟踪，来评估mNGS在真菌PJIs中的诊断效能及应用价值。
表1.病人数据、病原体鉴定、抗生素治疗、手术治疗及预后
研究成果
在该前瞻性研究中，首次报道了利用mNGS辅助诊断8例真菌性PJIs病例，并重点探讨了mNGS在治疗真菌性PJIs中的应用价值。如图1所示，该研究对入组患者的临床样本（术前滑膜液、假体周围组织、术中滑膜液、假体超声液）同时进行mNGS检测及培养。在8例患者的样本中，mNGS均鉴定到真菌，其中术前6例阳性，术中2例阳性。而培养仅检测到5例，其中术前2例阳性，术中3例阳性。同时，在检测周期方面，mNGS结果反馈时间一般不超过48h，而真菌培养结果反馈时间一般超过4天。
6例患者术前进行关节穿刺，收集的样本同时进行mNGS检测和培养，结果mNGS检测阳性6例，培养阳性仅2例。由于在真菌性PJIs治疗中应用真菌性药物灌注骨水泥已被证实是有效的，mNGS检测周期非常快，同时大大提高术前病原体检出率，对手术准备和术中用药具有重要价值。针对每一个病例，该研究收集了多种样本同时进行mNGS检测与培养，以验证mNGS在真菌性PJIs病原体诊断中的科学价值。从图1可以看出，mNGS检测到的病原体类型与各病例多种样本的培养结果高度一致。因此，说明在真菌性PJIs的病原体鉴定中，mNGS的检测结果是可靠且有价值的。
图1.8例患者不同样本mNGS和培养的检测结果及周期
该研究是首次报道了mNGS在真菌PJIs治疗中的应用价值。虽然该研究仅入组了8例患者，但鉴于真菌性PJIs发病率较小，该研究仍是迄今为止最大的真菌PJIs研究队列。研究结果显示mNGS在真菌病原体检测中显示出巨大的优势和应用价值，可以有效地辅助真菌性PJIs的临床管理。
研究结论
与传统培养相比，mNGS可以有效地提高PJIs中真菌病原体的检出率，特别是在术前检测中。从而帮助医生及时选择合适的靶向抗菌治疗和手术治疗，进一步提高真菌性PJIs治疗的成功率。因此，建议在处理疑似真菌病原体引起的PJIs时使用mNGS作为常规检查。
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