肠道疾病是当前家禽比较常发的疾病，主要表现为家禽的采食量下降，粪便较稀、红粪、过料、肠粘膜脱落和肠道出血等。引起家禽肠道疾病的原因很多，比如霉菌*素、肠道菌群失调、病*或细菌感染(大肠杆菌、沙门氏菌、病*性肠炎)、球虫疾病和坏死性肠炎等。
1、霉菌*素引起。霉菌*素大多数情况下是由于饲料或原料保管不善，被霉菌污染，霉菌代谢产生的*素积累于饲料中，家禽采食到这样的饲料，会使肠道黏膜受到破坏、肠壁变薄、肠道脆性增加，最终导致家禽肠道疾病的发生。另外，当使用劣质饲料原料时，不但能引起吸收不良和营养不平衡，还会破坏家禽肠道内环境，损坏肠黏膜，引起肠炎。目前我们常见的腺胃炎、肌胃炎大都也是有霉菌*素所引起。
2、坏死性肠炎。产气荚膜梭状芽孢杆菌是普遍存在的一种厌氧性微生物，是引起坏死性肠炎最主要的病原体。但引起坏死性肠炎的其他原因还很多，例如，饲料中的淀粉含量过高或蛋白质含量过高，都能引起产气荚膜梭状芽孢杆菌在肠道中繁殖，产生*素而发病。
3、球虫病。在家禽的整个养殖过程中，球虫病，尤其是小肠球虫病，一直是最普遍的影响肠道健康和生长效率的重要疾病之一，而感染球虫后所引发的肠道病原菌感染，也是引发肠道疾病的重要原因。
4、肠道菌群失调。临床上主要表现为泡沫盲肠粪便和橙色粪便；家禽可能存在“勾料”（将颗粒饲料甩出料盘），“料粪”（粪便中出现未被消化的饲料）；饮水量增加。发生菌群失调时，使用抗生素药物后，有时稀便可恢复正常，但以后的整个生长期内仍然易感，不能形成永久免疫力，病因不除，仍会复发。
5、细菌或病*感染。大肠杆菌和沙门氏菌等是生产中常见的引起肠道疾病的“罪魁祸首”，感染非常普遍，一旦进入家禽体内，就会破坏肠道微生物菌群的平衡，引发肠道疾病。病*性肠炎往往是呼肠孤病*和轮状病*等引起。
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