在年系列活动中,我们回顾了mNGS在感染性脑炎病原体诊断中的研究与应用进展。本期微远基因特别整理IDseq?通过优化RNA流程专属去宿主技术实现罕见RNA病*高敏检测的典型案例,让大脑不再是“黑箱”,结合AIdet自身免疫性脑炎抗体检测组合,让脑炎病因“显而易见”。
01.病史与主诉
患儿,女,6岁,患者1周前无明显诱因出现间断发热,热峰38.8℃,伴精神差,无呕吐、咳嗽、腹泻、性格异常及肢体障碍等,给予口服药物对症治疗,具体用药不详,效果差。4天前出现抽搐,表现为全面性发作,最长持续约20分钟,伴意识障碍,医院治疗。
现病史:
//医院(年11月27日)
血常规:白细胞25.08↑×10^9/L,血红蛋白g/L,红细胞压积37.9%,中性粒细胞百分比63.9%,淋巴细胞百分比26.7%,C反应蛋白5mg/L。
头颅CT:未见异常。
//医院(年11月28日)
血常规:白细胞6.65×/L,血红蛋白g/L,红细胞压积33.8%,中性粒细胞百分比67.7%,淋巴细胞百分比22.4%,C反应蛋白23mg/L↑。
脑脊液常规:淡*色,微浑,潘氏试验阴性,白细胞计数10×/L,红细胞计数×/L,淋巴细胞百分数37%,中性粒细胞百分数63%。
脑脊液生化:葡萄糖3.51mmol/L,氯mmol/L,脑脊液蛋白0.2g/L。
头颅CT:未见异常。
考虑“中枢神经系统感染”,医院给予“热*宁、头孢唑肟、甘露醇、醒脑静、咪达唑仑”等应用,患者仍间断抽搐,伴意识模糊。为进一步诊治,于年11月30医院就诊。
既往史:既往体健。
02.入院检查
体格检查:
体温36.5℃,脉搏82次/分,呼吸20次/分,血压/78mmHg,SPO%,意识模糊,双侧瞳孔等大等圆,直径4mm,对光反射迟钝,颈抵抗,呼吸表浅,四肢肌张力高,膝腱反射未引出,跟腱反射存在,布氏征阴性,双侧巴氏征阴性,双侧克氏征阴性,四肢温,CRT2S。
血常规、生化及其他检查:
血常规:白细胞计数4.50×/L,红细胞3.59×/L,血红蛋白g/L,血小板计数×/L,中性粒细胞百分比67.4%,淋巴细胞百分比29.1%,C反应蛋白8.37mg/L↑。血沉9mm/h。
PCT0.ug/L。
脑脊液检查:无色,清晰透明,潘氏试验阴性(-),白细胞计数0.×/L,单核细胞百分比88.3%,多核细胞百分比11.7%,其他偶见新鲜红细胞0-5/HP(土)。生化指标:葡萄糖3.07mmol/L,氯.1mmol/L,脑脊液蛋白.1mg/L。
头颅MRI:左侧海马走行区及颞叶钩回条片状DWI高信号,考虑水肿。
微生物实验室检查结果
传统微生物检测结果均为阴性,未发现结核分枝杆菌、隐球菌,排除自身免疫性脑炎,具体结果如表1所示。
表1微生物实验室检测结果
入院初步诊断:
中枢神经系统感染?
癫痫持续状态
03.进一步检查与诊治
由于患者诊断不明,且不能排除肠病*、日本乙型脑炎等病*性脑炎,故同时采集脑脊液样本至微远基因进行IDseq?检测。RNA流程回报检出星状病*MLB2特异性序列3条,结果如图1。
图1IDseq?RNA流程检出星状病*
患者疾病进程简要总结、治疗和预后:
综合患者临床症状,临床考虑病*感染可能性大,予以停头孢噻肟,并继续予阿昔洛韦抗感染,经抗癫痫治疗、降颅压、维持内环境稳定等综合治疗后,患者病情好转。
修正诊断为:
病*性脑炎
癫痫持续状态
入住监护室3天后未再抽搐,神志清,抗感染治疗结果印证了IDseq?检测结果的准确性。后转至普通病房神经内科继续治疗,后续病情变化如图2所示。
图2随访MRI检查结果
年2月开始对患者进行抗癫痫治疗,然而仍有局灶发作,表现为右侧上肢或左侧下肢抽动,持续约1-2分钟缓解,约半月发作1次,患儿有多动症状,后续病情变化仍在随访中。
图3年1月15日MRI检查报告单
04.经验与体会
星状病*是无囊膜包被的单股正链RNA病*,通常通过粪-口途径传播,可能引起胃肠道疾病1。随着mNGS技术的广泛应用,星状病*可引起脑炎、脑膜炎和脑脊髓炎的案例被逐渐报道,是严重中枢神经系统感染的潜在神经致病性病原体。除人类外,星状病*还可导致水貂、牛、绵羊、猪的脑炎2。
对于诊断不明确的中枢神经系统感染,IDseqTM能够尽早明确患者可能感染的病原体,为临床综合判断后及时调整治疗方向提供有效病原学依据。目前,尚无针对人或动物神经*性星状病*感染的特异性抗病*治疗方法。在人类感染神经*性星状病*病例中,静脉注射免疫球蛋白(IVIG)、甲基泼尼松龙、利巴韦林和聚乙二醇干扰素(PEG-IFN)α-2b的组合被用作非特异性抗病*治疗方法3。
系列活动回顾
·世界脑炎日,微远基因在行动
IDseq?2.0为疑难危重感染病患保驾护航
IDseq?2.0从海量宏基因组数据中探明感染微生物,实现感染性疾病病原体的快速、准确和全面鉴定,辅助临床感染诊疗,为疑难危重感染病患保驾护航。
我们深深明了
每一份珍贵样本的背后
都有一位亟待救治的病患
微远基因
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