非典型新城疫和大肠杆菌混合感染在部分养殖密集区发生频繁，且难于根除。使用药物治疗效果明显，但一段时间后又反复发作，而且往往是整个养殖区的散户几乎都会出现相同的症状。主要表现为：产蛋率下降2--4个点，零星死亡。解剖后可见明显的心包炎，肝周炎，肠道有灰黑色糊状内容物，肠粘膜脱落。回盲结节出血肿大，直肠出血，整个肠道可见病*斑。使用新城疫疫苗后抗体产生不高，维持时间较短。
带有普遍性的原因分析：
1，鸡舍普遍比较简陋。采用废砖块和泥土砌起的墙面内外都没有经过水泥处理，且都低矮封闭，棚顶白色絮状物遍布整个鸡舍。有的养殖户直接把鸡舍建在废旧的住房内，不利空气流通。鸡舍顶棚采用树干及树枝，杂草等物简单铺棚。地面属于土质地面，未经水泥处理。长期不处理鸡粪，水槽污垢严重，且损坏处较多，偶有漏水至料槽中，造成饲料变质。
2，鸡舍外围。鸡粪随意堆积，污水横流，更有严重者把鸡粪堆积场紧挨鸡舍后墙。鸡舍四周杂草丛生，距离交通道路较近。而且往往是每家的鸡舍之间几乎没有距离，互相紧邻或一墙之隔。
3，水质污染严重。大凡经常性出现大肠杆菌的鸡场，其水源都以地表水源居多。水井深不过十几米，很容易受到细菌污染。如果把鸡粪处理场所建在水源的上游，则更加剧了水源的污染。调查发现：水质的不合格是造成大肠杆菌连绵不断的主要原因。而新城疫的混合感染则是长期出现大肠杆菌致使使用新城疫疫苗失败。建议用水勿忧定期清理水线，如水质不好，用水勿忧长期饮水。
4，从不消*。调查的这块的几个村庄的养殖户，普遍很少，有的甚至从来没有使用过消*剂，加重了细菌的繁殖。
鉴于以上情况，主要针对水源问题进行了处理。首先把鸡粪的处理场所远离鸡舍并设置在水源的下游。有条件的鸡场尽可能的使用首层岩石以下的深井水。鸡舍四周从新使用水泥处理。清理四周杂草，并用水泥处理。顶棚采用板状物质加泡沫板隔热。坚持经常性消*。处理之后的鸡场很少再出现类似鸡病。
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