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腹泻是导致发展中国家儿童死亡的第二大原因，每年都会造成~万五岁以下儿童死亡。引发腹泻的原因有多种，如感染、中*、药物等会导致急性腹泻，一些疾病会导致慢性腹泻。
肠道菌群对维持肠道稳态和宿主的健康起着至关重要的作用，而腹泻的发生会对肠道菌群产生很大影响。随着近年来人体微生物组领域的深入研究，我们对肠道菌群与腹泻的关系有了进一步的了解。
下面我们通过4篇文献，看看在艰难梭菌、大肠杆菌、抗生素、维生素A缺乏等不同因素引起的腹泻人群中，其肠道菌群有什么不同。
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艰难梭菌引起的腹泻人群
Bloomandbust:intestinalmicrobiotadynamicsinresponsetohospitalexposuresandClostridiumdifficilecolonizationorinfection（）
期刊：MicrobiomeIF：8.
测序策略及平台：16SrDNA，V4区，MiSeq平台
难辨梭状芽孢杆菌感染（CDI）是院内腹泻的主要传染源。由于住院病人经常接受抗生素和其他药物，这会破坏肠道菌群的定植能力，医院环境中的艰难梭菌芽孢易乘虚而入，从而导致住院病人患CDI的风险增加。本文利用全基因组鸟枪法测序，研究了住院治疗的98例患者的肠道菌群多样性和菌群组成。
菌群分析
难辨梭状芽孢杆菌定植患者或感染患者的肠道菌群动态分析结果（图1），显示了微生物类群的相对丰度的变化、整体的微生物多样性、以及住院患者被定植（图1A-D）或感染（图1E-H）艰难梭菌属后细菌和人类DNA的比例关系。
病人住院期间，人类DNA含量和肠道菌群的组成和多样性是高度可变的。相比之下，细菌DNA的比例（在排除人类DNA后测定）更稳定。同时可以检测到微病*在30号、98号、99号病人体内有明显的增加，念珠菌和明串珠菌在艰难梭菌感染致腹泻病人体内增加。
随着人类测序reads数比例的增加，微病*相对丰度增加，但是微生物多样性却在下降。
图1难辨梭状芽孢杆菌定植或感染患者肠道菌群动态
面积图或条形图显示肠道菌群的变化；点划线代表Shannon指数（多样性）；虚线表示细菌DNA含量；实线表示感染人群（A-D）或定植人群(E-H)的人DNA含量。
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大肠杆菌感染引起的腹泻人群
Individual-specificchangesinthehumangutmicrobiotaafterchallengewithenterotoxigenicEscherichiacoliandsubsequentciprofloxacintreatment（）
期刊：BMCGenomicsIF：3.
测序策略及平台：16SrDNA，V1-V2区，平台
产肠*素大肠杆菌是引起腹泻的一大重要因素。肠道菌群对腹泻的发展的影响尚未被清晰阐明，本文招募12名志愿者，让他们感染大肠杆菌（H），其中5名引起腹泻反应，7名基本无腹泻症状，后期对腹泻志愿者进行环丙沙星进行治疗，同时利用16S测序对志愿者的肠道菌群变化进行研究。
菌群分析
测序结果表明，腹泻症状与高浓度的大肠杆菌密切相关，在腹泻人群中，肠道内的大肠杆菌数量明显增多且数量较大，而在无腹泻症状的人群中则检测到很少的大肠杆菌（图2）。
另外，从丰度图中还可以看出，腹泻人群中拟杆菌属（Bacteroides）、链球菌属（Streptococcus）、普雷沃菌属（Prevotella）、小杆菌属（Dialister）、Akkermansia、Blautia六个属的变化幅度比无明显症状人群高30%（图3）。
图2
a.腹泻患者样本中前十种最占优势属的丰度
b.无明显症状志愿者样本中前十种最占优势属的丰度
图3腹泻组（a）和无腹泻症状组（b）肠道菌群中丰度排前九的细菌属
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抗生素导致的腹泻人群
Structuralmodulationofgutmicrobiotaduringalleviationofantibiotic-associateddiarrheawithherbalformula（）
期刊：Internationaljournalofbiologicalmacromolecules
IF：3.
测序策略及平台：16SrDNA，V4区，MiSeq平台
抗生素滥用问题日益严重，滥用抗生素会对人体产生多种不良后果，其中之一就是导致腹泻症状。本文主要研究了抗生素（林可霉素）致腹泻的小鼠肠道菌群变化。然后使用中药参苓白术散对腹泻小鼠进行治疗，检测其对抗生素腹泻的治疗效果，以期能够找到对抗生素致腹泻有干预性疗效的传统中草药。
菌群分析
在属水平上，发现萨特氏菌属（Sutterella）在腹泻小鼠中的丰度明显比正常小鼠高。而给腹泻小鼠喂食一段时间的中药参苓白术后，菌群结构趋于正常化，体内萨特氏菌属数量明显下降（图4）。
此外，拟杆菌属（Bacteroides）、Paraprevotell、颤螺菌属（Oscillospira）、Parabacteroid、乳杆菌属（Lactobacillus）、真杆菌属（Eubacterium）等几个属在腹泻小鼠肠道中显著下降，而梭菌属（Clostridium）、Epulopiscium两个属在腹泻小鼠肠道中数量显著增加（表1）。
图4不同处理间样本内主要微生物属水平上相对丰度图
A不同处理间菌群主要微生物属水平的热图
B不同处理间菌群主要微生物属水平的柱状图
表1属水平上具有显著性差异的主要微生物
不同字母间表示具有显著性差异（P0.05）
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维生素A缺乏的腹泻人群
VitaminAdeficiencyimpactsthestructuralsegregationofgutmicrobiotainchildrenwithpersistentdiarrhea（）
期刊：Journalofclinicalbiochemistryandnutrition
IF：2.
测序策略及平台：16SrDNA，MiSeq平台
维生素A缺乏（VAD）是一个重要的营养问题，儿童基金会和世界卫生组织将其定义为全球公共卫生问题。维生素A缺乏被认为和持续性腹泻有关，据调查发现，在VAD儿童中，发生腹泻的概率是普通儿童中的2.37倍。而维生素A（VA）的补充可以降低儿童腹泻的发病率和死亡率。本文主要研究了VA缺乏对持续性腹泻儿童肠道微生物的影响。针对出生1—12个月龄的儿童，共选取59名腹泻儿童，其中有30名VA缺乏儿童，有29名是VA正常的儿童，收集粪便样品进行测序研究肠道菌群的组成结构。
菌群分析
结果显示（图5），VA缺乏组人群的肠道菌群多样性明显低于VA正常组，大肠杆菌和酪酸梭状芽胞杆菌是VA正常组人群肠道中关键菌种，而肠球菌在VA缺乏组中占优势。另外，faecalibacterium菌在VA缺乏组中也明显有所下降。总之，肠道菌群的多样性和关键种在不同VA营养水平腹泻儿童中明显不同。
图5VA缺乏组和VA正常组中具有显著性差异的20个主要的细菌属
“总结
通过上面几篇文献可以看出，艰难梭菌、产*素大肠杆菌、肠球菌等细菌和腹泻的发生密切相关。
不同原因的腹泻所导致的肠道菌群结构变化也不尽相同，菌属水平的变化有明显差异，表明了不同的因素对肠道菌群的影响结果不同，同时也会对人体产生不同的影响。
这也给了我们相应的提醒：针对不同因素导致的感染，可能需要采取不同的治疗措施，这样才能将腹泻对身体的损伤降到最小程度，并让我们更快地恢复健康。
供稿
张洪春
编辑
王丽燕
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