病*性病原体是急性呼吸道疾病最常见的病因，尽管经过多年的研究，目前对抗感染的预防和治疗策略仍显不足。流感病*是人类呼吸道感染最常见的原因之一，也是最重要的原因之一，因为它们可能造成高发病率和死亡率。另一个重要的病*性病原体是呼吸道合胞体病*，它是婴幼儿呼吸道感染的主要病原体，也是老年人呼吸道感染的新兴病原体。有证据表明，益生菌能够增强机体对呼吸道病*感染的抵抗力。
首次证明益生菌对流感病*感染的有益作用使用的是双歧杆菌。体外研究表明，双歧杆菌可以增加抗流感病*、抗轮状病*和抗脊髓灰质炎病*抗体的产生，以应对各自病*的感染。口服双歧杆菌可以保护小鼠免受流感病*的感染，降低流感病*感染的症状发生率，提高生存率。
呼吸道合胞体病*是一种RNA病*，研究人员利用鼻腔注射poly(I:C)模拟肺部RNA病*感染后的促炎症和病理结果，这可以诱导明显的肺功能受损，促炎症细胞因子产生和炎症细胞进入呼吸道。poly(I:C)还可以诱导呼吸道上皮细胞死亡和上皮屏障功能受损；此外，还可以导致中性粒细胞和单核细胞流入肺。这些病理结果与呼吸道合胞体病*感染类似。感染前补充鼠李糖乳杆菌可以显著减轻感染后的炎症损伤和病理改变。
一些临床试验评估了益生菌在预防人类呼吸道感染中的作用。大多数研究表明，益生菌可以降低呼吸道感染的发生率，也可以显著降低呼吸道感染后症状的严重程度和持续时间。
有研究调查了健康成年志愿者在流感疫苗接种后益生菌对疫苗特异性抗体反应的影响。研究表明补充特定益生菌菌株可以增加对疫苗接种的适应性免疫反应，包括黏膜和全身抗体反应。此外，补充益生菌后IgG1和IgG3均显著增加，表明Th1和Th2淋巴细胞活性均得到促进。
减少发展中国家学龄前儿童可预防性儿童疾病是一项重要的公共卫生目标，这不仅会影响死亡率，也会影响儿童的更好发育。据估计，每年有超过万5岁以下儿童死于肺炎和腹泻等可预防性感染性疾病。全球5岁以下儿童死亡中有21%可归因于营养不良及其与可预防感染性疾病的协同作用。益生菌可能可以提供一种潜在的干预措施，以减少常见的儿童疾病发生。
研究人员评估了补充益生菌酸奶对儿童肠道和非肠道相关疾病的影响，益生菌可以提高黏膜免疫，降低儿童肠道和呼吸道感染的发生率和严重程度。最常见的感染性疾病是上呼吸道感染，随后是咽喉炎、下呼吸道感染和腹泻。
补充益生菌的儿童中34%发生某种类型的感染时间，而在不补充益生菌的儿童中这一数值高达66%，表明益生菌可显著降低儿童感染性事件的发生。同时，研究人员以感染期间是否发烧以及是否需要抗生素治疗作为评价感染严重程度的指标。结果发现补充益生菌的儿童中，出现发烧的情况明显减少，对抗生素治疗的需求也轻微减少，表明感染严重程度的降低。
多项研究表明益生菌能够提高儿童的肠道免疫力，降低儿童对肠道致病菌的易感性。一些研究调查了益生菌在预防日托中心儿童呼吸道感染中的作用，随机双盲安慰剂对照研究表明，特定益生菌可以降低日托中心儿童呼吸道感染的数量；此外，还可以显著降低在儿科病医院呼吸道感染的风险。
总结：微生物群与全身粘膜免疫系统的相互作用参与调节局部和全身免疫。微生物群在人类免疫中发挥重要作用，包括抵抗感染、自身免疫紊乱、某些过敏和癌症等。因此，可以建议预防性地使用某些特定的益生菌来预防呼吸道感染，特别是那些经常发生呼吸道感染和使用抗生素的人群。
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