胰腺肿瘤微生物组研究；CancerCell
肿瘤内真菌诱导肿瘤细胞表达IL-33营造免疫抑制微环境）。然而，这些肿瘤内的微生物是真实存在的吗？这究竟是一场来源于污染的闹剧，还是技术突破带来的新发现？年，纽约大学GeorgeMiller和DeepakSaxena团队在Nature杂志上发表了一篇题为ThefungalmycobiomepromotespancreaticoncogenesisviaactivationofMBL的文章（后简称“文章”）。该研究表明，真菌可从肠腔内转移入侵胰腺，并参与胰腺导管腺癌（PDAC）的发生发展。具体地，该研究发现PDAC患者/小鼠的胰腺样本与健康对照的真菌组存在显著差异。其中，一种常见于皮肤的真菌——马拉色菌属在PDAC中富集。进一步的小鼠研究表明，该真菌可通过与宿主分泌的甘露糖结合凝集素（MBL）结合，活化补体C3，从而加速肿瘤形成。而口服抗真菌药或可通过阻断MBL-C3轴抑制小鼠PDAC进展。杜克大学PeterJ.Allen团队对上述文章的数据进行了重分析，并提出了质疑，相关结果于年8月2日发表在Nature杂志上。重分析的结果表明，胰腺组织中属于真菌的测序读数（reads）很少，且胰腺或肠道微生物组在健康人与PDAC患者之间不存在显著差异。具体地，PeterJ.Allen团队重点对文章提供的公开数据中的5个健康人胰腺组织样本、9个健康人的粪便样本数据（这部分数据并未在文章中展现）、13个PDAC组织样本和18个PDAC患者的粪便样本进行了分析。首先，PeterJ.Allen团队对数据质量进行了评估，发现大多数reads的平均质量在30分及以下。与Qiime1使用的OTU策略相比，目前通常认为DADA2采用的ASV策略得到的结果会更加精准。因此，PeterJ.Allen团队使用DADA2软件对数据进行了分析。DADA2的结果显示，在健康或恶性胰腺组织中都未发现丰富的真菌；文章中