常用的药物有：口服补液盐：目前WHO推荐新的低渗ORS液。
胃肠道黏膜保护剂：常见的有蒙脱石散，也要适当使用，以免继发便秘。
微生态制剂：主要成分为益生菌，一类为活菌，一类为死菌或其代谢产物。其中活菌不能与抗生素同时服用，最好在服用抗生素2小时后用。
抗生素：不要因大便中发现少量白/红细胞就用抗生素，会出现抗生素相关性腹泻。总体来说，病*感染引起的腹泻，以饮食和支持疗法为主，不必使用抗生素；非侵袭性细菌引起的腹泻，一般也只用饮食和支持疗法，可根据病情酌情选用抗生素。只有侵袭性和混合性细菌引起的腹泻需针对性使用抗生素。在确定有严重的细菌感染的情况下，由于大便培养至少要等3天才能得到结果，所以一般会先经验性使用抗生素，待培养结果出来后，再考虑是否需要更换抗生素。若使用抗生素，应连续使用至少5～7天，以免造成耐药或病情迁延。
一旦发生腹泻，要给予口服足够的液体以预防脱水，并保证营养摄入。母乳喂养的婴儿应继续母乳喂养，并且增加喂养的频次及延长单次喂养的时间；人工喂养的婴儿可以给予稀释牛奶和ORS液（如无ORS液或宝宝不愿意喝ORS液，可尝试稀释后的鲜榨果汁或清洁饮用水）；6个月以上的患儿可以继续食用已经习惯的日常饮食，鼓励患儿少量多次进餐，避免给患儿喂食含粗纤维的蔬菜和水果以及高糖食物。建议在每次稀便/呕吐后给予补充一定量的液体（6月龄50mL；6月龄～2岁mL；2岁～10岁mL；10岁以上的患儿能喝多少给多少）直到腹泻停止。补充液体的关键是均匀慢速，一次饮用液体过多会导致或增加呕吐。
一旦发生轻度到中度脱水，给予ORS液的用量（mL）=体重（kg）×（50～75），并且在4小时内服完（大约每分钟2～5mL）。如临近4小时，患儿仍有脱水表现，需要调整补液方案。4小时后重新评估患儿的脱水状况，然后再选择适当的方案。以下情况提示口服补液可能失败：①持续、频繁、大量腹泻（10～20mL/Kg.h），②ORS液服用量不足，③频繁、严重呕吐，可考虑改为静脉输液。
一旦发生重度脱水，需要静脉输液（注意，这只是快速补液的手段之一），在补液过程中，每1～2小时评估一次脱水情况，如无改善，则需适当加快补液速度。通常婴儿在静脉补液3～4小时后，儿童在静脉补液1～2小时后，可以给予ORS液。如无静脉输液条件，立即转运到其他医疗机构静脉补液，转运途中可以用鼻饲点滴ORS液进行补液，每1～2小时评估一次脱水情况。
母乳喂养或人工喂养的患儿若继发乳糖酶缺乏，可暂时给予改为低（去）乳糖配方奶，一般1～2周后腹泻好转可逐渐转为原有喂养方式。母乳喂养患儿也可以在母乳喂养的基础上，添加外源性乳糖酶。
可给予患儿适量补锌。治疗腹泻的同时补充锌可以缩短腹泻病程，减少迁延性腹泻的发生。WHO向全球推荐5岁以下急性或慢性腹泻患儿每天口服10～20毫克锌，持续10～14天。年版《儿童腹泻病诊断治疗原则的专家共识》建议6个月龄以上，每天补充含元素锌20mg，6个月龄以下，每天补充元素锌10mg。
此外，对发热等其他症状对症治疗和护理。注意臀部护理，注意口腔卫生。将患儿隔离，用品消*，以免传染他人。